MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 138229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_020054	TCAC	2	8	6763031	6763038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138002	NC_020054	TAAG	2	8	6763071	6763078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138003	NC_020054	TTG	2	6	6763150	6763155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138004	NC_020054	GGTC	2	8	6763214	6763221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138005	NC_020054	CTG	2	6	6763223	6763228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138006	NC_020054	A	6	6	6763238	6763243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138007	NC_020054	GGGA	2	8	6763258	6763265	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138008	NC_020054	GCCA	2	8	6763340	6763347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138009	NC_020054	GAC	2	6	6763374	6763379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138010	NC_020054	TGG	2	6	6763389	6763394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138011	NC_020054	TTGGC	2	10	6763425	6763434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138012	NC_020054	ATT	2	6	6763465	6763470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138013	NC_020054	TGTC	2	8	6763471	6763478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138014	NC_020054	CAC	2	6	6763513	6763518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138015	NC_020054	ACT	2	6	6763546	6763551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138016	NC_020054	TGA	2	6	6763600	6763605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138017	NC_020054	GAC	2	6	6763638	6763643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138018	NC_020054	TGA	2	6	6763679	6763684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138019	NC_020054	GAT	2	6	6763686	6763691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138020	NC_020054	CTTAT	2	10	6763797	6763806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138021	NC_020054	CCA	2	6	6763809	6763814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138022	NC_020054	TCGT	2	8	6763824	6763831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138023	NC_020054	GT	3	6	6763852	6763857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138024	NC_020054	AAT	2	6	6764005	6764010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138025	NC_020054	ATG	2	6	6764015	6764020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138026	NC_020054	ATT	2	6	6764050	6764055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138027	NC_020054	TAG	2	6	6764067	6764072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138028	NC_020054	AGG	2	6	6764077	6764082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138029	NC_020054	TAA	2	6	6764227	6764232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138030	NC_020054	GGT	2	6	6764260	6764265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138031	NC_020054	AGTT	2	8	6764316	6764323	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138032	NC_020054	CAA	2	6	6764489	6764494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138033	NC_020054	CGTT	2	8	6764518	6764525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138034	NC_020054	GCTTGG	2	12	6764592	6764603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138035	NC_020054	CTT	2	6	6764675	6764680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138036	NC_020054	CCT	2	6	6764687	6764692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138037	NC_020054	TCA	2	6	6764702	6764707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138038	NC_020054	GGT	2	6	6764761	6764766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138039	NC_020054	TTC	2	6	6764823	6764828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138040	NC_020054	GGC	2	6	6764853	6764858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436838865
138041	NC_020054	GCT	2	6	6764868	6764873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138042	NC_020054	CGCT	2	8	6764913	6764920	0 %	25 %	25 %	50 %	436838865
138043	NC_020054	CGC	2	6	6764924	6764929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838865
138044	NC_020054	AGG	2	6	6765010	6765015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436838865
138045	NC_020054	ACG	2	6	6765082	6765087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138046	NC_020054	A	6	6	6765171	6765176	100 %	0 %	0 %	0 %	436838865
138047	NC_020054	CGA	2	6	6765179	6765184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138048	NC_020054	CT	3	6	6765197	6765202	0 %	50 %	0 %	50 %	436838865
138049	NC_020054	GTC	2	6	6765207	6765212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138050	NC_020054	GCCCC	2	10	6765326	6765335	0 %	0 %	20 %	80 %	436838865
138051	NC_020054	GCC	2	6	6765339	6765344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838865
138052	NC_020054	CCA	2	6	6765355	6765360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436838865
138053	NC_020054	GGC	2	6	6765407	6765412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436838865
138054	NC_020054	A	6	6	6765417	6765422	100 %	0 %	0 %	0 %	436838865
138055	NC_020054	CGA	2	6	6765431	6765436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138056	NC_020054	GC	3	6	6765463	6765468	0 %	0 %	50 %	50 %	436838865
138057	NC_020054	AGC	2	6	6765469	6765474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138058	NC_020054	CGT	2	6	6765494	6765499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138059	NC_020054	TGC	3	9	6765571	6765579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138060	NC_020054	CCG	2	6	6765712	6765717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838865
138061	NC_020054	CAA	2	6	6765761	6765766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436838865
138062	NC_020054	GGT	2	6	6765770	6765775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436838865
138063	NC_020054	GAC	2	6	6765836	6765841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138064	NC_020054	GCGGG	2	10	6765844	6765853	0 %	0 %	80 %	20 %	436838865
138065	NC_020054	TCG	2	6	6765859	6765864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138066	NC_020054	GGTC	2	8	6765898	6765905	0 %	25 %	50 %	25 %	436838865
138067	NC_020054	GTTCG	2	10	6765921	6765930	0 %	40 %	40 %	20 %	436838865
138068	NC_020054	GCC	2	6	6765971	6765976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838865
138069	NC_020054	A	6	6	6765984	6765989	100 %	0 %	0 %	0 %	436838865
138070	NC_020054	GCA	2	6	6766064	6766069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
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138072	NC_020054	CAC	2	6	6766121	6766126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436838865
138073	NC_020054	GTG	2	6	6766134	6766139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436838865
138074	NC_020054	ACCA	2	8	6766185	6766192	50 %	0 %	0 %	50 %	436838865
138075	NC_020054	GGC	2	6	6766344	6766349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436838865
138076	NC_020054	CGA	2	6	6766367	6766372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138077	NC_020054	GGCG	2	8	6766387	6766394	0 %	0 %	75 %	25 %	436838865
138078	NC_020054	CG	3	6	6766429	6766434	0 %	0 %	50 %	50 %	436838865
138079	NC_020054	TTC	2	6	6766449	6766454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436838865
138080	NC_020054	GAC	2	6	6766508	6766513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138081	NC_020054	CAA	2	6	6766616	6766621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436838865
138082	NC_020054	CGA	2	6	6766667	6766672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138083	NC_020054	CGA	2	6	6766691	6766696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138084	NC_020054	CGA	2	6	6766858	6766863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138085	NC_020054	TACC	2	8	6766865	6766872	25 %	25 %	0 %	50 %	436838865
138086	NC_020054	ACG	2	6	6766917	6766922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138087	NC_020054	CA	3	6	6766928	6766933	50 %	0 %	0 %	50 %	436838865
138088	NC_020054	GCA	2	6	6766934	6766939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138089	NC_020054	GCA	2	6	6766958	6766963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138090	NC_020054	CGACCG	2	12	6767306	6767317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436838865
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138092	NC_020054	GCG	2	6	6767391	6767396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436838865
138093	NC_020054	GGCG	2	8	6767399	6767406	0 %	0 %	75 %	25 %	436838865
138094	NC_020054	CGG	2	6	6767435	6767440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436838865
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138098	NC_020054	TGA	2	6	6767584	6767589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436838865
138099	NC_020054	ACG	2	6	6767596	6767601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838865
138100	NC_020054	TTC	2	6	6767754	6767759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436838865
138101	NC_020054	AAC	2	6	6767895	6767900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436838866
138102	NC_020054	CCT	2	6	6767943	6767948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436838866
138103	NC_020054	T	6	6	6767950	6767955	0 %	100 %	0 %	0 %	436838866
138104	NC_020054	GCT	2	6	6767999	6768004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838866
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138106	NC_020054	CGA	2	6	6768053	6768058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838866
138107	NC_020054	GGT	2	6	6768161	6768166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436838866
138108	NC_020054	CAC	2	6	6768342	6768347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436838866
138109	NC_020054	CAT	2	6	6768404	6768409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436838866
138110	NC_020054	CCG	2	6	6768416	6768421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838866
138111	NC_020054	ACC	2	6	6768683	6768688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436838867
138112	NC_020054	GCGG	2	8	6768715	6768722	0 %	0 %	75 %	25 %	436838867
138113	NC_020054	CCAG	2	8	6768767	6768774	25 %	0 %	25 %	50 %	436838867
138114	NC_020054	TCG	2	6	6768830	6768835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436838867
138115	NC_020054	CGA	2	6	6768856	6768861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436838867
138116	NC_020054	GCC	2	6	6768936	6768941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436838867
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138228	NC_020054	ACTT	2	8	6775353	6775360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138229	NC_020054	GTTA	2	8	6775406	6775413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.